• اداره کل
  • مدیر کل
  • دفتر مدیر کل
  • دفتر روابط عمومی  و پیگیری
  • دفتر آموزش و پژوهش
  • اداره حفاظت اطلاعات
  • اداره ارزیابی عملکرد، بازرسی
  • فرماندهی یگان حفاظت
  • معاونت سلامت، اصلاح و تربیت
    • معاونت سلامت، اصلاح و تربیت
    • اداره امور فرهنگی تربیتی
    • اداره اشتغال و حرفه آموزشی
    • اداره بهداشت و درمان
      • واحد سلامت و درمانهای نگهدارنده
      • واحد بهداشت محیط
    • اداره امور مددکاری
    • مرکز مراقبت بعد از خروج
    • دفتر هماهنگی انجمنهای حمایت  زندانیان
  • معاونت توسعه مدیریت و منابع
    • معاونت توسعه مدیریت و منابع
    • اداره امور عمومی
      • واحد  کارگزینی و امور اداری
      • واحد  پشتیبانی و تدارکات
      • واحد امور مالی
    • اداره امور مالی
    • دفتر فنی و مهندسی
    • واحد آمار و رایانه
    • واحد دبیرخانه
  • معاونت قضائی و اجرای احکام
    • معاونت قضائی و اجرای احکام
    • اداره امور قضائی
    • دفتر حقوق شهروندی
• زندان و کانون
  • زندان کاشان
  • زندان نائین
  • زندان خمینی شهر
  • زندان گلپایگان
  • زندان شهرضا
  • زندان لنجان
  • زندان فریدن
  • بازداشتگاه خوانسار
  • کانون اصلاح و تربیت
• قوانين
  • آئين نامه جديد سازمان مصوب ٢٠/٩/٨٤
  • آئين نامه قديم سازمان مصوب ٢٦/٤/٨٠
  • آئين نامه مركز مراقبت بعد از خروج
  • قانون تبديل شوراي سرپرستي زندانها به سازمان زندانها
  • اساسنامه انحمن حمايت از زندانيان
  • آيين نامه مددكاري اجتماعي سازمان زندانها
• نهاد های وابسته
  • بنگاه تعاون ، حرفه آموزی و اشتغال زندانیان
  • انجمن حمایت زندانیان
  • ستاد دیه